Con base en las medidas implementadas por los órdenes federal y estatal, el día 03 de abril del año 2020, el Ayuntamiento Constitucional del Municipio de Tlajomulco de Zúñiga emitió la Declaratoria de Emergencia ante la Condición de Alto Riesgo Sanitario y Socio-organizativo Generada por el Virus SARS-CoV-2, para adoptar en todo el territorio municipal las acciones y medidas preventivas y de mitigación que determinaran las autoridades sanitarias del Gobierno Federal, del Gobierno del Estado de Jalisco, así como del Consejo Municipal de Salud y el Comité Municipal de Emergencia. Además, se realizó un protocolo de atención a pacientes con enfermedad respiratoria de Servicios Médicos Municipales.

Bajo las condiciones descritas, se creó el Plan Tlajomulco COVID-19, mismo que a más de un año de su creación sigue aplicándose y considera cinco sectores principales de intervención: Gobierno, Salud, Economía, Seguridad y Social.